Aneho possede un reseau scolaire qui reflete son histoire. L'ecole catholique, heritiere de la mission SVD, cotoie les ecoles publiques et quelques etablissements prives. Le lycee d'Aneho, fonde apres l'independance, a forme des generations de cadres togolais. Mais les defis restent nombreux : classes surchargees, manque d'equipements, exode des meilleurs eleves vers Lomé.

L'education est pourtant une priorite pour les familles d'Aneho. Les parents investissent une part importante de leurs revenus dans la scolarite de leurs enfants. Des associations d'anciens eleves financent des bourses et du materiel. L'ecole reste le principal ascenseur social dans une ville ou les opportunites economiques sont limitees.